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植物種に対応)
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 -
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(クローニングから対応)
免疫染色


CpGアイランドのDNAメチル化状態を網羅的にプロファイリング!

概  要

メチル化DNA抽出からデータ解析までのトータルサポート

細胞・組織より、メチル化DNAを抽出/精製してデータ解析まで一連のサービス
/サポートを提供致します。
アレイ/プラットフォーム
GenomicTree社(Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質
マイクロアレイ&プラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。
Fast Service
サンプルをお預かりしてから、約3週間で解析データ/実験報告書を提出致します。
解析データ
DNA品質データ/アレイ画像/生データ/正規化データ/Reliable gene data/Scatter &
MA plot/発現変動データを基本データとして、比較数/反復数/実験条件等に応じて
クラスタリング解析(Hierarchical, SOM、K-mean等)データを提供致します。
品質方針 (ISO9001:2000取得)
顧客の信頼を得る受託解析サービスの提供を心掛け品質マネジメントシステムの
継続的改善と技術の向上を計り、顧客の満足を高めます。




各CpGアイランドに複数箇所設計された長鎖プローブ搭載

CpG Islandアレイフォーマット CpG Islandアレイ アレイプローブ
Human CpG Island array 244k
Human 237,220アレイプローブは
27,800のCpGアイランド領域をカバー

2色蛍光法・・・2サンプル/1解析
Mouse CpG Island array 2x105k
Mouse 97,651アレイプローブは
16,030のCpGアイランド領域をカバ

2色蛍光法・・・2サンプル/1解析


メチル化DNA抽出/濃縮 (MeDIA: Methylated DNA Isolation & Amplification)



受託解析ワークフロー
ゲノムDNAまたは細胞/組織を送付いただき、DNA品質チェック、gDNAフラグメント
(超音波処理)、メチル化DNA抽出/濃縮(MBD2btタンパク質)、DNA増幅・ラベリング、
ハイブリダイゼーション、スキャニング、データ解析を行います

QCデータ DNA品質(メチル化DNA抽出・濃縮)チェック メチル化DNA QC Data PDF
レポート 実験報告書、スキーム、解析結果、Materias & Method 実験・結果報告書 PDF
画像データ Scanning image Cy3, Cy5アレイ画像 TIFF
Scatter Plot 分散図 JPEG
MA Plot 正規化分散図 JPEG
CGH explorer (Chromosome) map 遺染色体マップ JPEG
Clustering-tree view (Hierarchical, k-means, SOM) ヒートマップ JPEG
解析データ Row Data 数値化生データ Text
Normalized all genes data 全遺伝子正規化データ Excel
Reliable genes data(flag-out) 優位性遺伝子データ Excel
Hyper & Hypomethylated genes date メチル化/非メチル化遺伝子抽出データ Excel
Clustering -Hierarchical, k-means, SOM
(反復、比較数によります)*4
発現パターン類似遺伝子分類 Excel
*1 細胞サンプルを提供頂く場合
1. 10cmシャーレで細胞培養後、培地を捨てて、PBSで1回洗浄

2. 約1mlのTRIzolまたはISOGENを加え、ピペットでよく攪拌
3. サンプルをチューブに移して-80℃で凍結
4. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送
細胞からのDNA抽出はオプション(別途費用)となります

*2 組織サンプルを提供頂く場合
1. 組織片をチューブに入れて、サンプルが完全に浸るように
  TRIzolまたはISOGENを加える
2.
-80℃で凍結
3. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送
組織からのDNA抽出はオプション(別途費用)となります

*3 メチル化DNA抽出・濃縮
DNAおよび細胞または組織からの抽出DNAからメチル化DNAの
抽出/濃縮を行います-オプション(別途費用)となります

*4 解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験
内容・目的、サンプル数(条件比較数、反復回数等)により異なります




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