各遺伝子領域における染色体コピー数の異常、癌の遺伝子増幅、
染色体欠失を検出し、ゲノムワイドに解析


概  要

DNA抽出からデータ解析までのトータルサポート

細胞・組織より、DNAを抽出/精製してデータ解析まで一連のサービス/サポートを
提供致します。
アレイ/プラットフォーム
GenomicTree社(Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質
マイクロアレイ&プラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。
Fast Service
サンプルをお預かりしてから、約2〜3週間で解析データ/実験報告書を提出致します。
充実した解析データ
DNA品質データ/アレイ画像/生データ/正規化データ/Reliable gene data/Scatter &
MA plot/Chromasom map/増幅・欠失遺伝子データ/Gene Ontology/Pathway等を
基本データとして、比較数/反復数/実験条件等に応じてt-test、ANOVA、クラスタリング
解析(Hierarchical, SOM、K-mean等)データを提供致します。
品質方針 (ISO9001:2000取得)
顧客の信頼を得る受託解析サービスの提供を心掛け品質マネジメントシステムの
継続的改善と技術の向上を計り、顧客の満足を高めます。




遺伝子、遺伝子間、サブテロメア領域を含む240,000プローブを搭載

 CGHアレイフォーマット CGHアレイ
Human Genome CGH array 244k
Mouse Genome CGH array 244k
Rat Genome CGH array 244
Human Genome CGH array 2 x 105k
Mouse Genome CGH array 2 x 105k
Rat Genome CGH array 2 x 105k
2色蛍光法・・・2サンプル/1解析

実験ワークフロー
ゲノムDNAまたは細胞/組織を送付いただき、DNA品質チェック、gDNA増幅、
gDNA制限酵素処理、標識gDNA合成、ハイブリダイゼーション、スキャニング、
データ解析を行いを行います。

QCデータ DNAサンプル品質チェック DNA QC Data PDF
レポート 実験報告書、スキーム、解析結果、Materias & Method 実験・結果報告書 PDF
画像データ Scanning image Cy3, Cy5アレイ画像 TIFF
Scatter Plot 分散図 JPEG
MA Plot 正規化分散図 JPEG
CGH explorer (Chromosome) map 遺染色体マップ JPEG
Clustering-tree view (Hierarchical, k-means, SOM) ヒートマップ JPEG
解析データ Row Data 数値化生データ Text
Normalized all genes data (2色:LOWESS) 全遺伝子正規化データ Excel
Reliable genes data(flug-outl) 優位性遺伝子データ Excel
fold-change genes date (Gain/Loss遺伝子) 増幅/欠失遺伝子データ Excel
Gene Ontology 機能別遺伝子クラシフィケーション Excel
Pathway analysis パスウェイ遺伝子解析 Excel
t-test (反復数によります)*4 t検定統計解析 Excel
ANOVA -1way, 2way (反復、比較数によります)*4 統計解析 Excel
Clustering -Hierarchical, k-means, SOM
(反復、比較数によります)*4
発現パターン類似遺伝子分類 Excel

*1 細胞サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 10cmシャーレで細胞培養後、培地を捨てて、PBSで1回洗浄

2. 約1mlのTRIzolまたはISOGENを加え、ピペットでよく攪拌
3. サンプルをチューブに移して-80℃で凍結
4. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送

*2 組織サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 組織片をチューブに入れて、サンプルが完全に浸るようにTRIzol
  またはISOGENを加える
2.
-80℃で凍結
3. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送

*3 DNA抽出(細胞または組織)
細胞または組織からのDNA抽出はオプション(別途費用)となります

*4 解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験
内容・目的、サンプル数(条件比較数、反復回数等)により異なります。




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  PMRD:
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