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(Human, Mouse, Rat)
miRNAプロファイリング2
 
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  PMRD:
植物種に対応)
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その他受託解析
マルチプレックス
 -
サイトカイン/ケモカイン他

cDNAマイクロアレイ作製
 
(クローニングから対応)
免疫染色


遺伝子発現制御に関わるmiRNAを網羅的にプロファイリング


概  要

RNA抽出からデータ解析までのトータルサポート

細胞・組織より、Total RNAを抽出/精製して、miRNA脱リン酸化を行いデータ解析まで
一連のサービス/サポートを提供致します。
アレイ/プラットフォーム
GenomicTree社(Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質
マイクロアレイ&プラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。
Fast Service
サンプルをお預かりしてから、約3週間前後で解析データ/実験報告書を提出致します。
充実した解析データ
RNA品質データ/アレイ画像/生データ/正規化データ/Reliable gene data/Scatter &
MA plot/miRNA変動データ/miRNA target geneデータ等を基本データとして、比較数/
反復数/実験条件等に応じてt-test、ANOVA、クラスタリング解析(Hierarchical, SOM、
K-mean等)データを提供致します。
品質方針 (ISO9001:2000取得)
顧客の信頼を得る受託解析サービスの提供を心掛け品質マネジメントシステムの
継続的改善と技術の向上を計り、顧客の満足を高めます。



 
Sanger miRBase 情報を基にプローブ設計


miRNA解析用8x15kアレイフォーマット miRNAアレイ
Human miRNA array 8 x 60k
Mouse miRNA array 8 x 60k
Rat miRNA array 8 x 60k
1色蛍光法・・・1サンプル/1解析


実験ワークフロー
Total RNAまたは細胞/組織からRNA品質チェック、miRNA脱リン酸化、
標識miRNA合成、ハイブリダイゼーション、スキャニング、データ解析を行いを行います。


QCデータ RNAサンプル品質チェック RNA QC Data PDF
レポート 実験報告書、スキーム、解析結果、Materias & Method 実験・結果報告書 PDF
画像データ Scanning image Cy3, Cy5アレイ画像 TIFF
Scatter Plot 分散図 JPEG
MA Plot 正規化分散図 JPEG
Clustering-tree view (Hierarchical, k-means, SOM) ヒートマップ JPEG
解析データ Row Data 数値化生データ Text
Normalized all genes data (2色:LOWESS、1色:50th percentile) 全遺伝子正規化データ Excel
Reliable genes data(flug-outl) 優位性遺伝子データ Excel
fold-change genes date (2倍差発現遺伝子) 発現変動遺伝子データ Excel
miRNA target genes data (miRNA→mRNA) miRNAターゲット遺伝子データ Excel
t-test (反復数によります)*4 t検定統計解析 Excel
ANOVA -1way, 2way (反復、比較数によります)*4 統計解析 Excel
Clustering -Hierarchical, k-means, SOM
(反復、比較数によります)*4
発現パターン類似遺伝子分類 Excel
*1 細胞サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 10cmシャーレで細胞培養後、培地を捨てて、PBSで1回洗浄

2. 約1mlのTRIzolまたはISOGENを加え、ピペットでよく攪拌
3. サンプルをチューブに移して-80℃で凍結
4. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送

*2 組織サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 組織片をチューブに入れて、サンプルが完全に浸るようにTRIzol
  またはISOGENを加える
2.
-80℃で凍結
3. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送

*3 RNA抽出(細胞または組織)
細胞または組織からのRNA抽出はオプションとなります。別途費用

*4 解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験
内容・目的、サンプル数(条件比較数、反復回数等)により異なります。


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